康熙五十九年(1720)，清軍西征至今鄯善縣境內，討伐準噶爾。在此期間，額敏和卓以辟展阿奇木伯克的身份率眾歸附清朝。

　　雍正九年(1731)準噶爾部多次圍攻魯克沁，他率眾奮力抗擊，屢屢獲勝。

　　雍正十年(1732)，為避準噶爾的騷擾搶掠，率眾1萬余人東遷瓜州(今甘肅安西一帶)。清廷任命額敏和卓為札薩克輔國公，管理遷居事宜。　　乾隆十九年(1754)，清廷決定直搗準噶爾的大本營，收復伊犁，額敏和卓奉詔率領300士兵從征平叛。因其勇敢善戰，功績顯著，被清廷晉升為鎮國公。

　　乾隆二十一年(1756)額敏和卓率所屬居民8578人自瓜州遷回吐魯番盆地。當年吐魯番的“達爾漢伯克”莽噶里克發動叛亂，突襲殺害了辟展駐軍統領和士兵100余人，并脅迫額敏和卓參加叛亂。額敏和卓力拒不從，固守魯克沁城，并派人向清軍通報，為清軍平定叛亂創造了條件，清廷加封他為貝子。

　　乾隆二十二年(1757)南疆的阿勒輝、博多克臺站被準噶爾噶爾丹分裂勢力的殘余搶掠，將駐臺站兵丁殺死，額敏和卓得知后，率兵至托克遜駐扎。后隨清軍一起追擊殘匪，歷時4個月。保護了臺站的安全與暢通，清廷又賜予貝勒銜。

　　乾隆二十三年(1758)清廷任命額敏和卓為參贊大臣，隨同清軍平定大小和卓的叛亂。在攻打庫車之戰中，被擊傷右顴。他不顧傷痛，再次隨指揮官兆惠率兵4000人進抵葉爾羌城附近，數次與叛軍激戰，堅守陣地達3個多月之久，為平叛勝利做出了貢獻。

　　因額敏和卓在平叛中屢建戰功，于乾隆二十四年(1759)，乾隆帝加封他為多羅郡王，駐葉爾羌辦事，主管該地的民政和軍事，并且畫像于紫光閣，，乾隆皇帝為他親撰贊詞說：“吐魯番早年歸正，命贊軍務，以識回性，知無不言，言無不宜，其心匪石，不可轉移。”

　　乾隆四十二年(1777)額敏和卓因年老體衰病死。